Es gibt eine Reihe von Apps für das Munzee-Spielen. Die offizielle App wird immer zum Erfassen von allen Munzees sowie zum verteilen von physischen Munzees benötigt. Andere Apps bietet zusätzliche Statistiken bzw. Funktionen, die die offizielle Munzee App nicht hat.

Die offizielle Munzee App von Munzee Inc. ist kostenlos für Android und iOS verfügbar und lässt sich über den jeweiligen App-Store auf dem Smartphone installieren.

Die App bietet in der Grundsicht ein Karte, auf der alle in der Umgebung befindliche Munzees angezeigt werden. Über den Menüpunkt „Filter“ am unteren Bildschirm lässt sich einstellen, welche Munzee-Typen nicht angezeigt werden sollen.
In der Grundeinstellung direkt nach dem Download der App werden nur Greenies angezeigt. Es ist daher sinnvoll, nach Installation der App zuerst den Filter zu bearbeiten.
Über die drei waagerechten Streifen „≡“ links oben erreicht man das Menü der App, in dem sich unter anderem diverse Einstellungen vornehmen und das eigene Profil anzeigen lassen.

Das Verteilen von Munzees über die App ist im Wikiartikel Deploy beschrieben, das Erfassen im Artikel Capture.

Eine umfassendere Erläuterung der App erfolgt nach Release von Version 4.0, die in den nächsten Wochen erwartet werden kann. (Stand Anfang Juli 2018)

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Die Zee-App für Android und iOS ist ebenfalls von Munzee Inc. und bietet ergänzende Statistiken zur Munzee-App. Weitere Informationen sind im Wikiartikel zu Zee zu finden.

MunzStat ist eine unabhängig entwickelte App für Android, welche umfassende Statistiken und Informationen zu den eigenen Munzees, erspielten Punkten etc. bietet. Weitere Informationen sind im Wikiartikel zu MunzStat zu finden.

Für die Outdoor-Karten App LocusMap gibt es ein Add-on für das Munzee spielen. Weitere Informationen sind im Wikiartkel Locus Munzee zu finden.

Seit Juni 2020 gibt es die App CuppaZee, mit der Spieler auf zahlreiche Statistiken mobil zugreifen kann. CuppaZee gab es vorher nur als Website und wird Stück für Stück nun in die App transportiert, die es für iOS und Android gibt.